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#核酸适配体筛选专题#五、微量DNA样品透析(含操作小视频)

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#筛选专题#五

微量DNA样品透析(含操作小视频)

背景介绍

 

透析是利用半透膜将小分子和大分子分离的一种技术,已成为生物化学实验室最简便最常用的分离纯化技术之一。在生物大分子的制备过程中,除盐、除少量有机溶剂、除去生物小分子杂质和浓缩样品等都要用到透析的技术。 通常半透膜制成的透析袋作为工具,无法处理微量样品。核酸适配体筛选得到的aptamer文库,如果要保持较高浓度用于下一轮筛选,通常体积大概会在200ul以内,针对这种微量样品的透析,目前的手段比较有限,文章介绍了一种简便的方法和小工具,可以方便的用于微量样品的透析。


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实验方法

透析只需要使用专用的半透膜即可完成。通常是将半透膜制成袋状,将生物大分子样品溶液置入袋内,将此透析袋浸入水或缓冲液中,样品溶液中分子量较大的生物分子被截留在袋内,而盐和小分子物质不断扩散透析到袋外,直到袋内外两边的浓度达到平衡为止。保留在透析袋内未透析出的样品溶液称为“保留液”,袋外的溶液称为“渗出液”或“透析液”。透析温度通常情况下是4℃,升高温度可加快透析速度,频繁更换透析溶液,也可使透析效果更好。

透析膜可用动物膜和玻璃纸等,但用的较多的是用纤维素制成的透析膜,通常我们说的15000、25000、100000、250000等,表示的是单位道尔顿(D),截留分子量越大也就是说透过性越大。购买透析膜时需要选择合适的截留分子量,选择截留分子量值约为要保留的大分子分子量的一半,以获得至少90%的保留率。针对于核酸适配体文库使用的透析膜分子量通常为3.5KD的规格,适配体文库可以被很好的保留,而有机溶剂和盐等经过4度过夜透析,会被很好的去除。

 

 
 

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图:透析装置以及透析膜的使用方法

操作步骤

1.实验材料准备:长度约2.5cm×2.5cm的透析袋;微量透析装置(可以用离心管盖加工处理);透析液(一般为筛选缓冲液,如PBS等)

2. 将需要透析的DNA文库加入微量透析装置中,然后盖上透析膜,用密封圈封紧透析装置。(详见视频)

3. 把适量的透析液(缓冲液)加入50ml离心管或者是其他烧杯等容器中。透析液的体积应为样品体积量的100倍以上。(例如,在20ml以上透析液中透析200ul的样品)

4.把透析样品装置放入透析缓冲液中。透析时间根据具体的需求,通常情况下,4度过夜透析。透析的过程中,更换几次透析液效果会更好。

注意:透析袋一旦变湿,应浸泡在溶液中,不要让透析袋干燥。不断干燥会造成孔隙结构不可恢复的变化。

这种方法有较高的回收率,能够节约珍贵的样品,并能节约时间,特别适合摸条件的预实验。

使用这种方法能简单地透析核酸适配体筛选过程中的微量单链DNA 片段。本方法不需要昂贵的设备,回收率很高,能够节约珍贵的样品,纯化得到的 DNA 质量非常稳定,可放心用于下一轮筛选。




↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓视频(49秒)↓↓↓↓↓↓↓↓↓↓

以下视频提供了核酸适配体筛选过程中微量DNA透析过程,供参考

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2019-05-28 10:17
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