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#核酸适配体筛选专题#一,乳浊液PCR--内含操作视频
核酸适配体(aptamer)是指通过指数富集的配基系统进化技术(Systematicevolution of ligands by exponential enrichment,简称SELEX)筛选分离得到的DNA或者RNA分子,也称为化学抗体。它可以与靶标如蛋白质、金属离子、小分子、多肽甚至整个细胞进行高亲和力和特异性的结合。与传统的抗体相比,核酸适配体具有分子量小,稳定性更好,无批次间差异性,易改造修饰,无免疫原性,制作周期短,可以通过人工合成等优势,免去了动物免疫、饲养、蛋白提取和纯化等一系列流程。这些优点使其在生物医学领域具有广阔的应用前景,因此在基础研究及应用研究领域均呈现了快速发展的趋势。
넶1354 2019-05-28 -
#核酸适配体筛选专题#二、乳浊液PCR产物快速高效回收及浓缩--内含操作视频
核酸适配体筛选中的乳浊液PCR(emulsion PCR)是利用油包水乳液体系中的微液滴作为反应器进行的PCR扩增体系。近年来乳浊液PCR在生物医学领域的应用越来越广,可以实现在每个微液滴中进行单分子模板的扩增反应,从而避免常规PCR扩增过程中出现的扩增偏好(PCR bias)问题,提升核酸适配体的筛选成功率
넶1320 2019-05-28 -
#核酸适配体筛选专题#三、长短链法制备ssDNA单链--切胶、碎胶、煮胶(内含操作视频)
核酸适配体筛选过程中,单链制备是非常重要的一步,单链的质量也关乎筛选的成败。
单链制备方法有多种,发表文献里常见的方法有以下几种:
1、Biotin修饰引物后用SA磁珠分离方法;2、长短链法;将反义链加长,需要电泳跑胶分离两条链;3、酶解法:可以使用lambda酶切,成本较低,但是可能出现不完全酶切;4、不对称PCR法:条件不是很好控制。넶2390 2019-05-28 -
#核酸适配体筛选专题#五、微量DNA样品透析(含操作小视频)
透析是利用半透膜将小分子和大分子分离的一种技术,已成为生物化学实验室最简便最常用的分离纯化技术之一。在生物大分子的制备过程中,除盐、除少量有机溶剂、除去生物小分子杂质和浓缩样品等都要用到透析的技术。 通常半透膜制成的透析袋作为工具,无法处理微量样品。核酸适配体筛选得到的aptamer文库,如果要保持较高浓度用于下一轮筛选,通常体积大概会在200ul以内,针对这种微量样品的透析,目前的手段比较有限,文章介绍了一种简便的方法和小工具,可以方便的用于微量样品的透析。
넶1850 2019-05-28 -
#核酸适配体筛选专题#四、单链DNA PAGE煮胶液回收浓缩(含操作视频)
核酸适配体筛选过程中,单链制备是非常重要的一步,单链的质量也关乎筛选的成败。上一个专题我们已经介绍了用长短链方法制备ssDNA的切胶、碎胶、煮胶的步骤。本次专题主要介绍如何将煮沸出来的约2ml包含DNA的溶液浓缩和纯化。
넶1321 2019-05-28 -
核酸适配体的高通量测序
넶877 2019-06-11
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名称→1-F类型→DNA靶标→CD117靶标类别→蛋白质
넶84 2019-10-24 -
名称→4-1BB07类型→DNA靶标→4-1BBLigand靶标类别→蛋白质
넶57 2019-10-24 -
名称→8-OHdG(22)类型→DNA靶标→8-OHdG靶标类别→其他
넶84 2019-10-24 -
名称→A1类型→DNA靶标→StaphylococcusaureusenterotoxinA(SEA)靶标类别→蛋白质
넶46 2019-10-24 -
名称→AbrinToxin(TA6)类型→DNA靶标→AbrinToxin靶标类别→蛋白质
넶39 2019-10-24
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核酸适配体的未来何在?---微信群里初步探讨
2017年1月在微信群里进行的一次讨论,集中在偏宏观一点的问题(适配体的前景,目前面临的主要问题,未来的研究方向等),再讨论一些实验中的细节问题。未来适配体研究的重点在哪里?大家碰到的困难是什么?在方向上先达成共识,我们今后可以在核心问题上,进行合作,重点攻关。
넶663 2019-03-13 -
核酸适配体筛选常见问题解答
利用SELEX技术筛选核酸适配体,在国内发展已经十年有余,但是目前筛选的瓶颈依然是筛选的方法。核酸适配体筛选步骤繁多,耗时长,为了大家更好的交流实验中遇到的问题,于2015年06月26日在QQ群邀请罗昭锋老师做了一次在线答疑活动,期间大家交流的问题我后期做了一下整理,如下。(以下的回答都是出自笔者根据在线交流的内容整理所得,有不全面的地方还希望大家多多包涵。希望对大家有所帮助。)
넶1984 2019-03-13
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